Гордона Фрімена виводить зі стазису Джи-Мен, який садить його в поїзд, що прибуває в місто 17. Після прибуття на станцію та втечі від сил Синдикату Гордон приєднується до членів опору Лямбда, включаючи Барні Калхуна, колишнього охоронця чорної Меси, який зараз працює під прикриттям офіцером ЦРУ Синдикату, та Алікс Венс, дочка одного з колишніх колег Гордона, доктора Елі Венса. Після невдалої спроби телепортувати Гордона в східну частину чорної Меси з імпровізованої лабораторії доктора Кляйнера, Гордон, переобладнаний в скафандр HEV і з ломом, змушений відправитися пішки по старій системі міських каналів. Здобувши аеробот, він з боєм пробирається до східної частини Чорної Меси, в декількох милях від міста. Гордон знову знайомиться з Ілаєм і зустрічає доктора Джудіт Моссман. Алікс знайомить Гордона зі своїм великим домашнім роботом D0g і дарує йому "гравітаційну гармату", зброю, яка дозволяє Гордону з легкістю піднімати і переміщати будь-які великі предмети. Східна частина чорної Меси незабаром піддається нападу синдикату, і Ілай з Моссманом потрапляють у полон, щоб бути доставленими до В'язниці синдикату на Нова Проспект. Гордон і Алікс змушені піти окремими шляхами до Нового проспекту; Гордон робить гачок через місто Равенгольм, отримуючи допомогу від останнього вцілілого, батька Григорія. Пройшовши через місто і шахту, Гордон потрапляє на форпост опору. Гордону надається баггі, на якому він пересувається по руйнується прибережній дорозі до Нова-проспекту. По дорозі Гордон часто стикається з патрулями синдикату і допомагає одному з лідерів опору, полковнику Одесі Каббедж, захищати базу опору від бойового корабля Синдикату. Після перетину пляжу, зараженого мурашиними левами, Гордон потрапляє на Нова проспект, де возз'єднується з Алікс. Їм вдається знайти Елі, але Моссман також виявляється інформатором Синдикату. Перш ніж вони зможуть зупинити її, вона телепортує себе та Елі назад до міста Цитадель 17. Телепортатор Синдикату вибухає, коли Гордон і Алікс використовують його для втечі з Нового проспекту. Діставшись до лабораторії Клейнера, шокований доктор Клейнер розповідає Гордону та Алікс, що вони потрапили в "повільну телепортацію", під час якої пройшов тиждень. За їх відсутності опір, дізнавшись про те, що сталося на новому проспекті, мобілізувався проти комбінату, перетворивши місто 17 на поле бою. Під час бою Алікс був схоплений Синдикатом і доставлений до Цитаделі, а Гордон за допомогою D0g і Барні пробрався через місто, щоб дістатися до неї. Усередині Цитаделі він потрапляє в камеру конфіскації Синдикату, яка знищує всю його зброю, за винятком гравітаційної гармати, енергія якої збільшує його можливості і дозволяє Гордону врятуватися і знищити взводи солдатів Синдикату. Зрештою Гордона захоплюють, коли він їде в транспортній капсулі Комбайна, і доставляють до кабінету доктора Бріна, де вони з доктором Моссманом чекають разом з Елі та Аліксом у полоні. Доктор Брін починає пояснювати свої плани щодо подальшого завоювання людей Синдикатом, всупереч тому, що він сказав доктору Моссману. Розлючений Моссман звільняє Гордона, Алікс та Елі, перш ніж Брін телепортує їх за межі планети. Доктор Брін намагається втекти через портал, але Гордон переслідує його і знищує портальний реактор за допомогою надзарядженої гравітаційної гармати. Брін, очевидно, був знищений під час вибуху. Незадовго до того, як Гордона і Алікс, імовірно, спіткала та ж доля, час застигло. Джи-Мен з'являється знову, вихваляючи Гордона за його дії в місті 17 і цитаделі. Туманно згадуючи про " пропозиції послуг [Гордона]", Джи-Мен знову вводить його в ступор.

1998. HALF-LIFE приголомшує ігрову індустрію своїм поєднанням захоплюючого екшену і безперервного, захоплюючого оповідання. зараз. Зберігаючи інтригу, виклик і інтуїтивний заряд оригіналу, а також додаючи вражаючий реалізм і оперативність, Half-Life 2 відкриває двері в світ, де присутність гравця впливає на все навколо - від фізичного оточення до поведінки і навіть емоцій як друзів, так і ворогів.