Версия игры для SNES имеет ту же форму режима VS и Action mode, что и ее предшественница. Однако между старой и новой версиями имеются некоторые заметные различия. Во-первых, графика значительно улучшена и наполнена насыщенными цветами, которые делают игру гораздо более эстетичной, чем ранние версии игры. Дизайн Yoshi - еще одно важное отличие, эволюционирующее от его воплощения в NES в тот, который больше похож на тот, что можно увидеть на острове Yoshi. В версии для SNES есть дополнительный режим головоломки, в котором игроки должны очистить игровое поле за ограниченное количество ходов. В этом режиме есть 100 уникальных головоломок.