Istorija seka Aleksu Shepherdu, jaunuoliu, kuris grįžta į savo gimtąjį miestą Shepherd ' s Glen po tariamo karinio išrašymo ir laiko, praleisto ligoninėje dėl kovos su sužalojimais. Aleksas grįžta namo tik sužinojęs, kad jo tėvas ir jaunesnysis brolis Joshua dingo be žinios, kaip ir daugelis kitų visame mieste. Jis randa savo motiną depresinėje, netoli katatoninės būsenos. Aleksas mieste ieško dingusio brolio, atskleisdamas keistų įvykių priežastis ir tamsias kaimyninio Silent Hill miesto paslaptis.

Silent Hill: Homecoming yra šeštoji Silent Hill išgyvenimo siaubo serijos dalis. Žaidimas yra toks pat, kaip ir ankstesni įrašai, kai žaidėjas ieško daiktų ir naudoja ginklus, kad apsigintų nuo groteskiškų monstrų, spręsdamas galvosūkius, kad žengtų toliau į žaidimą. Kalbant apie kovą, žaidėjas sugeba atlikti lengvas ir sunkias atakas arba jas maišyti, kad atliktų derinius. Pirmą kartą serijoje žaidėjas gali pasirinkti atsakymus, kai užmezga dialogą su kitais žaidime sutiktais personažais, o tai savo ruožtu gali turėti įtakos tam, kaip žaidėjas mato siužetą.