Mega Man Zero

Lebih dari satu abad setelah kekalahan Sigma dalam seri Mega Man X, pemerintahan baru bernama Neo Arcadia dibentuk untuk menjaga perdamaian. Para pemimpin Neo Arcadia mulai memburu Reploid secara tidak adil dengan melabeli mereka sebagai Mavericks. Sekarang satu-satunya harapan untuk Reploid adalah Reploid legendaris: Pahlawan Merah bernama Zero. Merasa Reploid dituduh secara keliru, Ciel melarikan diri dari Neo Arcadia dan menciptakan Perlawanan terhadap Neo Arcadia. Permainan dimulai saat Ciel dan sekelompok kecil tentara perlawanan diburu oleh Panteon dan Golem. Beberapa tentara perlawanan tertinggal, tetapi mereka tidak dapat menghentikan kemajuan mereka. Dikejar, Ciel mencapai pintu besar. Passy, peri Sibernya berkata: "Saya merasakan energi yang kuat memancar dari sini. Ini pasti tempatnya."Setelah itu, tentara meledakkan pintu, dan Ciel, Passy, dan Milan memasuki ruangan, dengan tubuh Zero yang tak bernyawa di tengah ruangan, tidak aktif selama 100 tahun. Milan mencoba menyentuhnya, tetapi dia dipukul mundur oleh perisai energi yang melindungi Zero. Saat mereka mencoba mencari cara untuk melewati perisai, Panteon muncul di pintu. Milan memerintahkan Ciel untuk lari, dan mati, ditabrak oleh salah satu Pantheon. Passy memberi tahu Ciel: "Kamu harus menggunakan kekuatanku. Kau tak punya pilihan."Ciel berpikir sementara Pantheon semakin dekat, dan setuju dengan sedih. Pengorbanan Passy mematahkan perisai energi dan menghidupkan kembali Zero. Dia membantu Ciel, dan mengetahui bahwa Mega Man X (meskipun sebenarnya salinannya) adalah orang yang bertanggung jawab atas Reploid innocent yang dipensiunkan.