Marvel: Ultimate Alliance 2

Lugu avaneb, kui Nick Fury juhib sanktsioneerimata kangelaste meeskonda, sealhulgas kapten Ameerika, Wolverine, Ämblikmees ja Raudmees, Varjatud streigis Doomi loss aastal Lätimaa, pärast avastamist, et selle peaminister on relvi suunanud supervillainidele. Aasta hiljem naaseb vaenlane kättemaksu otsima, vallandades New Yorgi hävitamise. Pärast hävingut ja Fury ebaseaduslikku tegevust hakkab Ameerika Ühendriikide valitsus kaaluma üliinimliku registreerimise seadust. Kui hilisem katastroof nõuab sadu tsiviilelusid, surutakse tegu läbi, purustades superkangelaste kogukonna kibedateks vastandlikeks laagriteks. Kui Kapten Ameerika ja tema liitlased lähevad maa alla, samal ajal kui Raudmees toetab uut seadust, mängijad tõmbuvad sellesse kodusõda ja peavad valima, kas seista registreerimise pooldaja või registreerimisvastase poolega.