Syphon Filter

Gabriel Logan a Lian Xing jsou agenty agentury, na stopě Ericha Rhoemera, mezinárodního teroristy. V srpnu 1999 se Agent Ellis pokusil infiltrovat Rhoemerovu narkotickou operaci v Guácimu v Kostarice, ale byl objeven a popraven bývalou agentkou KGB Marou Aramovovou. Rhoemer poté nařídil Anton Girdeux, francouzský žoldák, vypálit plantáž, aby skryl důkazy o jejich výzkumu sifonového filtru. Ve Washingtonu, D.C., Edward Benton, zástupce ředitele agentury, informuje Loganovu misi s ředitelem agentury Thomasem Markinsonem a temnou, nejmenovanou postavou. O několik týdnů později Gabe a Lian vyšetřují záhadnou virovou epidemii v Himalájích, která ponechává pouze jediného přeživšího. (Lian to popisuje jako nemožné.) Hra začíná měsíc po událostech v Kostarice. Rhoemer a jeho teroristé zahájili útok na Washington, DC Gabe porazí Pavla Kravitche, rhoemerova komunikačního experta, který mu umožňuje získat vstup do Washingtonského metra. Jakmile je uvnitř, vybuchne výbušnina a Gabe zůstane uvězněn pod zemí. Pronásleduje Aramova a chytí ji v tunelech, než se vydá do nedalekého parku, aby pomohl zneškodnit několik virových bomb, kde se dozví, že Aramov unikl vazbě. Na cestě k památníku svobody se Gabe ujme a porazí Jorge Marcose, rhoemerova spouštěče, než spálí Girdeaux. Laboratorní výsledky ukazují, že Syphon Filter je smrtící biologická zbraň nové generace, schopná zaměřit se na konkrétní demografické skupiny. Jonathan Phagan, generální ředitel a zakladatel společnosti PHARCOM, se účastní gala ve svém novém muzeu Expo Center v New Yorku, kde je zajat Aramovem a Benton je odhalen jako dvojitý agent. Gabe zabije Bentona a osvobodí Phagana, ale Aramov, který je zajat, opět unikne vazbě. Gabe jde na rhoemerovu tajnou základnu v Rozova, Kazachstán. Zabije rhoemerova velitele Vladislava Gabreka a zničí základnu, ale Lian je zajata a pravděpodobně zabita Rhoemerem. Gabe je poté poslán infiltrovat rhoemerovu pevnost v Užhorodu na Ukrajině, což je opuštěná Katedrála. Injekce virových pacientů s tím, o čem je přesvědčen, že je protijed, Gabe sestupuje hlouběji do katedrály, aby zachránil Lian; kdo vysvětluje, že na virus neexistuje "globální" protijed. Najdou také Phagana, kterého později zabil Aramov. Rozhodne se pomoci Gabe a Lian,protože nemá kam jít. Gabe poté infiltruje sklady PHARCOM v Almaty, Kazachstán, kde pharcom security bojuje s Rhoemerovými muži. Gabe se dozví, že Markinson, který tajně vyjednával s Rhoemerem o získání sifonového filtru pro agenturu, přiměl Gabe vstříknout pacientům chlorid draselný. Rhoemer odhaluje, že zajal jadernou ICBM ze sovětské éry. Rhoemer zastřelí Markinsona a zahájí odpalovací sekvenci rakety. Gabe mu nemůže zabránit ve spuštění, takže jeho jedinou nadějí je zahájit jeho sebezničující sekvenci, jakmile bude v horní atmosféře. Gabe úspěšně zničí raketu. Rhoemer, zuřivý nad loganovým zásahem, ho zapojí do závěrečného zúčtování. Gabe je schopen ho zabít a odvrátit třetí světovou válku. V post-úvěrové scéně drží temná postava ze začátku hry vzorek Syphonového filtru uvnitř sídla agentury s Aramovem, který se směje.