تجري اللعبة في أعقاب الكارثة ، وهو حدث كارثي أدى فجأة إلى كسر مدينة كيلونديا وكذلك المناطق المحيطة بعالم اللعبة إلى العديد من القطع العائمة ، مما أدى إلى تعطيل بيئتها وتحويل معظم سكانها إلى رماد. يتحكم اللاعبون في الطفل ، بطل الرواية الصامت الذي يستيقظ على واحدة من القطع القليلة المتبقية من العالم القديم وينطلق إلى المعقل الذي يحمل نفس الاسم ، حيث كان من المفترض أن يذهب الجميع في الأوقات العصيبة. الناجي الوحيد الذي يلتقي به هناك هو رجل مسن يدعى روكس ، راوي اللعبة ، الذي يأمره بجمع النوى التي كانت تعمل في السابق على تشغيل كايلونديا. يمكن لجهاز في المعقل استخدام قوة النوى البلورية لإنشاء كتل أرضية وهياكل ، وكذلك تمكين الطفل من السفر إلى أبعد من ذلك عبر" الممرات الجوية " التي تدفعه عبر الهواء. أثناء سعيه ، يلتقي الطفل باثنين آخرين من الناجين: زلف ، سفير من أورا ، أشخاص يعيشون تحت الأرض كانت كايلونديا في حالة حرب معهم ؛ و ضياء ، فتاة أورا نشأت في كيلونديا. يعود كلاهما إلى المعقل ، ولكن عند قراءة مجلة يكتشفها الطفل ، قام زلف عمدا بإتلاف أجزاء من الجهاز المركزي للمعقل (النصب التذكاري) ويعود إلى منطقة أورا. يتعلم الطفل أن المجلة تخص والد ضياء ، فين ، الذي كان يعمل لدى الكيلونديين. لقد ساعد علماء كايلونديان ("مانسرز") في بناء سلاح يهدف إلى تدمير أورا تماما لمنع حرب أخرى. قام فين بتزوير السلاح ليأتي بنتائج عكسية ، لذلك عندما أجبر أخيرا على إطلاقه ، دمرت الكارثة الناتجة معظم كيلونديا أيضا. لإصلاح تلف زلف في المعقل ، يبدأ الطفل في جمع القطع ، وهو شكل أقل من النوى. عندما حصل على الشظية قبل الأخيرة المطلوبة ، هاجم أورا المعقل وألحق الضرر به واختطف ضياء. في الأيام السبعة التالية ، ينخرط الطفل في مناوشات متفرقة في إقليم أورا. عندما انفجر أخيرا عبر بؤرة استيطانية في أورا وقابل ضياء ، أخبرته أنها غادرت مع أورا طواعية لمعرفة نواياهم ؛ كان روكس قد أخبر ضياء سابقا أن المعقل لديه القدرة على إصلاح الكارثة بطريقة ما. يسافر الطفل إلى موطن أورا الذي كان تحت الأرض لاستعادة القشرة الأخيرة. هناك ، يكتشف أن زلف يتعرض للهجوم من قبل شعبه: المعركة مع كيد دمرت قوات أورا ، ويلومون زلف على إحضار الطفل إلى منزلهم. يمكن للطفل اختيار إسقاط سلاحه لمساعدة زلف أو تركه. إذا ترك زولف خلفه ، فإن الطفل يدمر بقايا أورا ويهرب عبر طريق جوي. إذا اختار حمل زلف ، فإن رماة أورا يفتحون النار عليهم في البداية لكنهم يتوقفون عن إطلاق النار في النهاية ويشاهدون بصمت بينما يأخذ الطفل وزلف الطريق الجوي إلى المعقل. بعد أن يعود الطفل ويتعافى ، يمنحه روكس خيارا آخر: يمكنه الحصول على وقت الترجيع قبل الكارثة على أمل منعها ، أو استخدامه لإجلاء الناجين والانتقال إلى مكان آمن. روكس غير متأكد مما إذا كان هناك أي طريقة لمنع تكرار الكارثة إذا تم إعادة لف الوقت ، حيث لم تكن هناك طريقة لاختبار العملية. تنتهي اللعبة في كلتا الحالتين ، حيث تعرض صورا للشخصيات (مع تضمين زلف إذا اختار اللاعب إنقاذه) وهي تطير بعيدا أو عن حياتهم قبل الكارثة جنبا إلى جنب مع الاعتمادات. في وضع اللعبة+ الجديد ، الذي يتم فتحه بعد التغلب على اللعبة مرة واحدة ، تم التلميح إلى أن استعادة العالم لم تمنع الكارثة.

آر بي جي الإختراق والقطع يضم الراوي رد الفعل, مختلف الأسلحة أونلوكبل, ترقيات سلاح, ممارسة الألعاب المصغرة ومعدلات صعوبة اختياري, المنصوص عليها في عالم وهمي في أعقاب نهاية العالم غير مؤكد, الذي لاعب يجسد في سن المراهقة مع ماض مضطرب كما هو والراوي العمل معا لإعادة بناء العالم من محور مستمر يسمى معقل.