Действие происходит спустя шесть лет после событий Resident Evil 2. Повзрослевший и значительно закаленный Леон С. Кеннеди сформировался под влиянием пережитого им бедствия, которое стерло Раккун-Сити с лица земли, и событий за его пределами. Теперь Леон подчиняется непосредственно президенту Соединенных Штатов Америки и получает новое задание: найти и спасти похищенную дочь президента. Проследив ее местонахождение до уединенной деревушки в сельской местности Европы, Леон готовится сделать первые шаги навстречу очередному кошмару, который выходит за рамки разумного.
